main_hero_img
posted: November 07, 2021 edited: November 07, 2021

codon translation tables

translationcodons

I've provided the codon usage files here as both downloadable links and tables on the page. If you would like a particular organism to be added please contact me. 

Downloads

ecoli file: ecoli_codon_usage_table.csv
human file: human_codon_usage_table.csv

Ecoli table

codon amino_acid frequency
TAA * 0.61
TAG * 0.09
TGA * 0.3
GCT A 0.18
GCC A 0.26
GCA A 0.23
GCG A 0.33
TGT C 0.46
TGC C 0.54
GAT D 0.63
GAC D 0.37
GAA E 0.68
GAG E 0.32
TTT F 0.58
TTC F 0.42
GGT G 0.35
GGC G 0.37
GGA G 0.13
GGG G 0.15
CAT H 0.57
CAC H 0.43
ATT I 0.49
ATC I 0.39
ATA I 0.11
AAA K 0.74
AAG K 0.26
TTA L 0.14
TTG L 0.13
CTT L 0.12
CTC L 0.1
CTA L 0.04
CTG L 0.47
ATG M 1
AAT N 0.49
AAC N 0.51
CCT P 0.18
CCC P 0.13
CCA P 0.2
CCG P 0.49
CAA Q 0.34
CAG Q 0.66
CGT R 0.36
CGC R 0.36
CGA R 0.07
CGG R 0.11
AGA R 0.07
AGG R 0.04
TCT S 0.17
TCC S 0.15
TCA S 0.14
TCG S 0.14
AGT S 0.16
AGC S 0.25
ACT T 0.19
ACC T 0.4
ACA T 0.17
ACG T 0.25
GTT V 0.28
GTC V 0.2
GTA V 0.17
GTG V 0.35
TGG W 1
TAT Y 0.59
TAC Y 0.41

Human table

codon amino_acid frequency
TAA * 0.28
TAG * 0.2
TGA * 0.52
GCT A 0.26
GCC A 0.4
GCA A 0.23
GCG A 0.11
TGT C 0.45
TGC C 0.55
GAT D 0.46
GAC D 0.54
GAA E 0.42
GAG E 0.58
TTT F 0.45
TTC F 0.55
GGT G 0.16
GGC G 0.34
GGA G 0.25
GGG G 0.25
CAT H 0.41
CAC H 0.59
ATT I 0.36
ATC I 0.48
ATA I 0.16
AAA K 0.42
AAG K 0.58
TTA L 0.07
TTG L 0.13
CTT L 0.13
CTC L 0.2
CTA L 0.07
CTG L 0.41
ATG M 1
AAT N 0.46
AAC N 0.54
CCT P 0.28
CCC P 0.33
CCA P 0.27
CCG P 0.11
CAA Q 0.25
CAG Q 0.75
CGT R 0.08
CGC R 0.19
CGA R 0.11
CGG R 0.21
AGA R 0.2
AGG R 0.2
TCT S 0.18
TCC S 0.22
TCA S 0.15
TCG S 0.06
AGT S 0.15
AGC S 0.24
ACT T 0.24
ACC T 0.36
ACA T 0.28
ACG T 0.12
GTT V 0.18
GTC V 0.24
GTA V 0.11
GTG V 0.47
TGG W 1
TAT Y 0.43
TAC Y 0.57